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      lexogen
      產(chǎn)品時間:2020-04-14
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      quantseq_mainimage  lexogen

      QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒,用于Illumina

      在QuantSeq文庫制備過程中節(jié)省成本并簡化了球蛋白mRNA的消耗

      全基因組基因表達分析

      具有成本效益的微陣列和標準RNA-Seq替代品

      總RNA輸入低100 pg

      適用于低質(zhì)量和FFPE樣品

      在Bluebee的免費數(shù)據(jù)分析管道®基因組學(xué)分析平臺

      單讀數(shù)測序,多達9,216個樣品/泳道

      提供雙重索引和唯yi分子標識符(UMI)

      QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備試劑盒,用于Illumina

      QuantSeq FWD試劑盒是一種文庫制備方案,旨在生成與聚腺苷酸化RNA的3'末端接近的Illumina兼容文庫。

      QuantSeq FWD在第二條鏈合成引物中包含Illumina Read 1接頭序列,因此朝poly(A)尾部生成NGS讀數(shù),直接反映了mRNA序列(請參見工作流程)。此版本是基因表達分析的推薦標準。Lexogen進一步提供了具有可選雙索引(i5和i7索引)的高通量版本,允許在一個通道中多路復(fù)用多達9,216個樣本。

       

      低投入低質(zhì)量樣品分析

      總RNA的所需輸入量低100pg。QuantSeq適合從低質(zhì)量的RNA(包括FFPE樣品)可重復(fù)生成文庫。相同樣品的兩種不同RNA品質(zhì)(FFPE和新鮮冷凍冷凍塊)的比較

      QuantSeq文庫制備過程中耗盡球蛋白mRNA

      新! 用于QuantSeq的Globin塊模塊可從全血中僅50 ng的總RNA中生成缺失珠蛋白的,易于測序的3'mRNA-Seq文庫。無需其他協(xié)議步驟。該模塊中的RS-Globin Block解決方案僅取代了QuantSeq試劑盒中的標準RNA去除解決方案。使用Globin Block進行QuantSeq,可將映射到球蛋白mRNA的讀圖從50%到80%降低到5%(圖4),并且基因檢測顯著增加(圖5)。

      *對于附圖:輸入RNA(50 ng或250 ng)的提取方法如下:1個 SPLIT RNA提取試劑盒,2個其他試劑盒(包括紅細胞裂解液)或3個其他試劑盒沒有紅細胞裂解液

       

      快速周轉(zhuǎn)

      QuantSeq的簡單工作流程允許僅在4.5小時內(nèi)(包括不到2小時的動手時間)生成即可測序的NGS庫。

      基因表達定量的直接計數(shù)

      每個轉(zhuǎn)錄本僅產(chǎn)生一個片段;因此,不需要長度標準化。這樣可以更準確地確定基因表達值,并使QuantSeq成為基因表達研究中微陣列和常規(guī)RNA-Seq的佳替代品。

       

      簡單的生物信息學(xué)分析

      通過跳過結(jié)檢測,可以簡化讀取映射。在轉(zhuǎn)錄物的3'末端幾乎沒有連接處產(chǎn)生讀數(shù)。因此可以加速數(shù)據(jù)處理。

       

      QuantSeq數(shù)據(jù)分析管道還集成在Bluebee基因組學(xué)分析平臺上,即使沒有生物信息學(xué)背景,任何用戶也可以使用。訪問代碼包含在QuantSeq套件中。可以在網(wǎng)上商店購買其他代碼。*:直到2019年12月31日,免費提供高達1.5 GB輸入的附加代碼。

       

      高鏈特異性

      QuantSeq保持> 99.9%的異常鏈特異性,并允許將讀數(shù)映射到基因組上的相應(yīng)鏈,從而能夠發(fā)現(xiàn)和定量反義轉(zhuǎn)錄本和重疊基因。

       

      節(jié)省成本的復(fù)用

      QuantSeq庫旨在用于高度復(fù)用。單個索引套件(目錄號015)中多包括96個i7索引。還可以使用Lexogen i5 6 nt雙索引附加組件(目錄號047或015.384)引入其他i5索引。一起使用,Lexogen的96 i7和96 i5 6 nt索引可為測序提供多達9,216種不同的索引組合。

       

      新!QuantSeq 3'mRNA-Seq文庫制備物現(xiàn)在也可提供多達384種預(yù)混合的*雙索引(目錄號113、114、115)。Lexogen的新型12 nt UDI具有出色的糾錯功能,可大程度地輸出測序數(shù)據(jù),也可作為獨立的附加套件(目錄號107 – 111)與其他文庫制備工具一起使用。

       

      這種高水平的多路復(fù)用可以節(jié)省成本,因為QuantSeq中的長度限制可以節(jié)省測序空間。QuantSeq還設(shè)計用于產(chǎn)生短測序讀段(SR50,SR100)的插入片段大小。

       

      北京華新康信生物科技有限公司專注于生命科學(xué)領(lǐng)域,由豐富從業(yè)經(jīng)驗的技術(shù)團隊和管理團隊組建而成,主營生物化學(xué)試劑,儀器,實驗耗材等。

      1廣泛的產(chǎn)品輻射領(lǐng)域,試劑,耗材,儀器等。

      2產(chǎn)品種類齊全,北京華新康信與國外諸多生命科學(xué)領(lǐng)域*合作眾多,代理品牌Glycan Therapeutics,Intact Genomics,Integral Molecular,Medkoo,Niomech,Terragene,Anshlabs wako,EZbioscience,CMCTAG,Anatrance ,F(xiàn)avorage ,Affinity,Advanced biomatrix,bioplastics,天地人和,TRC,凱杰,義翹,sciencell;價格優(yōu)勢品牌:seracare,Streck,Toxin,Zeptometrix,sigma,F(xiàn)orteBio,CanSyn,polyplus,santa,chormsystems,bethyl ,moltox, permagenlabware ,bioflux,Bio-Rad, coriell,   listlabs, ZYMO , ABclonal  , EY laboratories  ,greatcellsolar , agdia , beckman , Bioxcell,,biomax ,usascientific , TRC ,nist ,americanelements,cayman  , Fisher ,thermofisher ,  nanopore,   日立,  三菱株式會社 ,RD, takara等,緊跟生命科學(xué)的發(fā)展,不斷滿足客戶的需求,為各位的科研之路上添磚加瓦!

      3 一手貨源,價格優(yōu)勢明顯

      4信譽良好,客戶范圍廣,包括清華、北大、交大、復(fù)旦、中山等100多所高校,百泰藥業(yè),康龍化成,藥明康德等企業(yè)。

       

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